Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHPF2Q9P2E5 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms