Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU4

SMURF2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF2Q9HAU4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
SMURF2Q9HAU4 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SMURF2Q9HAU4 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms