Protein–RNA interactions for Protein: Q9H611

PIF1, ATP-dependent DNA helicase PIF1, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIF1Q9H611 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIF1Q9H611 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms