Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
TRIM4Q9C037 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms