Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
UTP4Q969X6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
UTP4Q969X6 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms