Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
REEP3Q6NUK4 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
REEP3Q6NUK4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms