Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KLHL40Q2TBA0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms