Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACKR1Q16570 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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