Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERC3Q15034 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERC3Q15034 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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