Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TRIM29Q14134 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms