Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CHAF1AQ13111 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CHAF1AQ13111 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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