Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MRPL28Q13084 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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