Protein–RNA interactions for Protein: P80162

CXCL6, C-X-C motif chemokine 6, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL6P80162 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
CXCL6P80162 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms