Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLK1P49759 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLK1P49759 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLK1P49759 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLK1P49759 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLK1P49759 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLK1P49759 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLK1P49759 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLK1P49759 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms