Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PRG2P13727 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRG2P13727 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms