Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
IFITM1P13164 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
IFITM1P13164 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms