Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS11DO60235 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS11DO60235 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms