Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 CYP2W1-205ENST00000468456 557 ntTSL 416.87■□□□□ 0.293e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 TOX4-201ENST00000416256 724 ntTSL 516.83■□□□□ 0.283e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 TOX4-204ENST00000455138 549 ntTSL 416.45■□□□□ 0.223e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 TOX4-209ENST00000487242 544 ntTSL 216.35■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.23e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 SMOX-206ENST00000457205 1669 ntTSL 516.25■□□□□ 0.193e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 TOX4-202ENST00000447695 633 ntTSL 416.21■□□□□ 0.193e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.183e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.183e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 ROBO3-208ENST00000527245 3255 ntTSL 216.09■□□□□ 0.173e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 CYP2W1-204ENST00000462453 566 ntTSL 415.87■□□□□ 0.133e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 SELENOW-211ENST00000599874 636 ntTSL 215.64■□□□□ 0.093e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 TMEM74B-202ENST00000429036 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.35■□□□□ 0.053e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 SELENOW-213ENST00000601419 717 ntTSL 215.23■□□□□ 0.033e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 ROBO3-216ENST00000531545 473 ntTSL 214.95□□□□□ -0.023e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 TOX4-210ENST00000494242 650 ntTSL 314.88□□□□□ -0.033e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.043e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.173e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 TOX4-205ENST00000455393 2000 ntTSL 213.8□□□□□ -0.23e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.213e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.213e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.253e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 TOX4-206ENST00000457430 565 ntTSL 413.42□□□□□ -0.263e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.323e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.343e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 ERGIC3-202ENST00000348547 1359 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.443e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 ERGIC3-205ENST00000413587 977 ntTSL 512.29□□□□□ -0.443e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 SELENOW-207ENST00000598956 1032 ntTSL 212.19□□□□□ -0.463e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.483e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 ERGIC3-220ENST00000640748 832 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.513e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 COPS8-201ENST00000354371 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.513e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 TOX4-211ENST00000613005 3633 ntTSL 211.2□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 ERGIC3-206ENST00000416206 1235 ntTSL 511.12□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 SELENOW-203ENST00000595509 675 ntTSL 311.01□□□□□ -0.653e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 TOX4-203ENST00000448790 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.673e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 TOX4-212ENST00000613569 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.793e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 PTCHD4-201ENST00000339488 2850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 ERGIC3-219ENST00000496172 781 ntTSL 210□□□□□ -0.813e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 SMOX-211ENST00000494098 812 ntTSL 59.36□□□□□ -0.913e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 ERGIC3-214ENST00000482338 598 ntTSL 28.76□□□□□ -1.013e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 MIR135B-201ENST00000362189 97 ntBASIC8.32□□□□□ -1.083e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 ATAD2-207ENST00000534257 544 ntTSL 45.11□□□□□ -1.593e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.763e-11■□□□□ 11
PRPF4O43172 PCSK6-210ENST00000559499 3325 ntTSL 215.78■□□□□ 0.123e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 PCSK6-209ENST00000559430 338 ntTSL 312.71□□□□□ -0.373e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.937e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 SLC39A5-208ENST00000447080 380 ntTSL 519.43■□□□□ 0.77e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 SLC39A5-203ENST00000419232 833 ntTSL 319.19■□□□□ 0.667e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.637e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 FNDC3B-202ENST00000415807 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 PHPT1-204ENST00000463215 627 ntTSL 213.75□□□□□ -0.219e-10■□□□□ 11
PRPF4O43172 POLR3E-215ENST00000565551 645 ntTSL 514.4□□□□□ -0.12e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.018e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 SLC25A1-205ENST00000470922 1598 ntTSL 222.84■■□□□ 1.253e-10■□□□□ 11
PRPF4O43172 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.183e-10■□□□□ 11
PRPF4O43172 SLC25A1-203ENST00000461267 804 ntTSL 322.22■■□□□ 1.153e-10■□□□□ 11
PRPF4O43172 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.113e-10■□□□□ 11
PRPF4O43172 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-202ENST00000579125 1318 ntTSL 1 (best)20.53■□□□□ 0.885e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.135e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.285e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 TBCK-204ENST00000394708 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.577e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 TBCK-202ENST00000361687 3312 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.827e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 TBCK-203ENST00000394706 3349 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.917e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.937e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 TBCK-206ENST00000467183 3566 ntTSL 1 (best)8.85□□□□□ -0.997e-7■□□□□ 11
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PRPF4O43172 TBCK-217ENST00000510927 2826 ntTSL 25.09□□□□□ -1.597e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.483e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.33e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.293e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 GRB7-208ENST00000485182 879 ntTSL 216.57■□□□□ 0.243e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 GRB7-209ENST00000577695 612 ntTSL 514.09□□□□□ -0.153e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 GRB7-211ENST00000583813 560 ntTSL 413.95□□□□□ -0.183e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 GRB7-213ENST00000584819 1146 ntTSL 213.89□□□□□ -0.193e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 GRB7-210ENST00000578702 630 ntTSL 313.16□□□□□ -0.33e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 ITPR2-209ENST00000545235 540 ntTSL 1 (best)7.89□□□□□ -1.154e-10■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.12e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-219ENST00000487964 902 ntTSL 515.6■□□□□ 0.092e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.022e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-220ENST00000492709 1248 ntTSL 514.24□□□□□ -0.132e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-213ENST00000469126 756 ntTSL 514.16□□□□□ -0.142e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-206ENST00000460389 1075 ntTSL 513.58□□□□□ -0.242e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-222ENST00000494153 757 ntTSL 513.2□□□□□ -0.32e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-205ENST00000460225 443 ntTSL 513.15□□□□□ -0.32e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-203ENST00000344042 847 ntTSL 513.04□□□□□ -0.322e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-223ENST00000496438 699 ntTSL 512.29□□□□□ -0.442e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-207ENST00000464173 587 ntTSL 212.22□□□□□ -0.452e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-217ENST00000483310 755 ntTSL 311.6□□□□□ -0.552e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.572e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-209ENST00000464661 906 ntTSL 311.22□□□□□ -0.612e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-212ENST00000469097 801 ntTSL 510.96□□□□□ -0.652e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 HM13-214ENST00000472128 865 ntTSL 59.6□□□□□ -0.872e-9■□□□□ 11
PRPF4O43172 RBM26-206ENST00000472143 2192 ntTSL 227.4■■□□□ 1.984e-10■□□□□ 11
PRPF4O43172 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.011e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 WDR59-223ENST00000616369 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.481e-7■□□□□ 11
PRPF4O43172 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.52e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 LMBR1L-205ENST00000547670 1866 ntTSL 1 (best)17.62■□□□□ 0.412e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 LMBR1L-202ENST00000417750 2334 ntTSL 216.95■□□□□ 0.32e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 LMBR1L-203ENST00000457164 1081 ntTSL 216.8■□□□□ 0.282e-6■□□□□ 11
PRPF4O43172 LMBR1L-206ENST00000547675 581 ntTSL 516.8■□□□□ 0.282e-6■□□□□ 11
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