Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTDSP2O14595 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
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