Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQK5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQK5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQK5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQK5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
U3KQK5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
U3KQK5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQK5 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQK5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQK5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQK5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQK5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQK5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQK5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQK5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQK5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
U3KQK5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQK5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQK5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQK5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQK5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQK5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQK5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
U3KQK5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQK5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQK5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQK5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQK5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQK5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQK5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQK5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQK5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQK5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQK5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQK5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQK5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
U3KQK5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQK5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQK5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQK5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQK5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQK5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQK5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQK5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQK5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQK5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQK5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
U3KQK5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
U3KQK5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQK5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQK5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQK5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQK5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQK5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQK5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQK5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQK5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
U3KQK5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQK5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQK5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQK5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQK5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQK5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQK5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQK5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQK5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQK5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQK5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQK5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
U3KQK5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
U3KQK5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms