Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G7

PCDHGA6, Protocadherin gamma-A6, humanhuman

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGA6Q9Y5G7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA6Q9Y5G7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA6Q9Y5G7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA6Q9Y5G7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA6Q9Y5G7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA6Q9Y5G7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHGA6Q9Y5G7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHGA6Q9Y5G7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCDHGA6Q9Y5G7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCDHGA6Q9Y5G7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms