Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
AFG3L2Q9Y4W6 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
AFG3L2Q9Y4W6 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFG3L2Q9Y4W6 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms