Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Q9Y3F1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Q9Y3F1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Q9Y3F1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Q9Y3F1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms