Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y277

VDAC3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC3Q9Y277 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
VDAC3Q9Y277 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VDAC3Q9Y277 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VDAC3Q9Y277 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms