Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SHOC2Q9UQ13 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SHOC2Q9UQ13 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SHOC2Q9UQ13 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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