Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP24Q9UPU5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
USP24Q9UPU5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
USP24Q9UPU5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms