Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PHF8Q9UPP1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
PHF8Q9UPP1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
PHF8Q9UPP1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PHF8Q9UPP1 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms