Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SYNRGQ9UMZ2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SYNRGQ9UMZ2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SYNRGQ9UMZ2 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
SYNRGQ9UMZ2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms