Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULZ9

MMP17, Matrix metalloproteinase-17, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP17Q9ULZ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MMP17Q9ULZ9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MMP17Q9ULZ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
MMP17Q9ULZ9 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MMP17Q9ULZ9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms