Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MRTO4Q9UKD2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRTO4Q9UKD2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MRTO4Q9UKD2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1886.5 ms