Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GPN3Q9UHW5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GPN3Q9UHW5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GPN3Q9UHW5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180 ms