Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHV7

MED13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED13Q9UHV7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
MED13Q9UHV7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MED13Q9UHV7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MED13Q9UHV7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MED13Q9UHV7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms