Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLIP2Q9UDT6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP2Q9UDT6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLIP2Q9UDT6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLIP2Q9UDT6 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms