Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD0

HSFX1, Heat shock transcription factor, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSFX1Q9UBD0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
HSFX1Q9UBD0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HSFX1Q9UBD0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSFX1Q9UBD0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.5 ms