Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SPRR3Q9UBC9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPRR3Q9UBC9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPRR3Q9UBC9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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