Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VPS18Q9P253 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VPS18Q9P253 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
VPS18Q9P253 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VPS18Q9P253 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms