Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM9Q9P0T7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM9Q9P0T7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM9Q9P0T7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM9Q9P0T7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM9Q9P0T7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms