Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN4

EHD2, EH domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD2Q9NZN4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
EHD2Q9NZN4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD2Q9NZN4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD2Q9NZN4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EHD2Q9NZN4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EHD2Q9NZN4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EHD2Q9NZN4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EHD2Q9NZN4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD2Q9NZN4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD2Q9NZN4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD2Q9NZN4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD2Q9NZN4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD2Q9NZN4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD2Q9NZN4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD2Q9NZN4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EHD2Q9NZN4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.4 ms