Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
MARCH5Q9NX47 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
MARCH5Q9NX47 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MARCH5Q9NX47 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MARCH5Q9NX47 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms