Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX09

DDIT4, DNA damage-inducible transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT4Q9NX09 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
DDIT4Q9NX09 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DDIT4Q9NX09 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DDIT4Q9NX09 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms