Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWH7

SPATA6, Spermatogenesis-associated protein 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA6Q9NWH7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SPATA6Q9NWH7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SPATA6Q9NWH7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
SPATA6Q9NWH7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SPATA6Q9NWH7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms