Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ATG3Q9NT62 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ATG3Q9NT62 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ATG3Q9NT62 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
ATG3Q9NT62 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ATG3Q9NT62 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms