Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VPS45Q9NRW7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
VPS45Q9NRW7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VPS45Q9NRW7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms