Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLDQ9NQC7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYLDQ9NQC7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CYLDQ9NQC7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CYLDQ9NQC7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
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