Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FZD3Q9NPG1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FZD3Q9NPG1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FZD3Q9NPG1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FZD3Q9NPG1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms