Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU5

PREB, Prolactin regulatory element-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREBQ9HCU5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PREBQ9HCU5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PREBQ9HCU5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PREBQ9HCU5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PREBQ9HCU5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms