Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ZNF408Q9H9D4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
ZNF408Q9H9D4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZNF408Q9H9D4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZNF408Q9H9D4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms