Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRDM12Q9H4Q4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PRDM12Q9H4Q4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRDM12Q9H4Q4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms