Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
MFSD1Q9H3U5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MFSD1Q9H3U5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MFSD1Q9H3U5 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms