Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN4Q9H254 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN4Q9H254 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTBN4Q9H254 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTBN4Q9H254 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms